Em Assembleia Geral realizada em 17 e 18 de janeiro de 2009, o Soylocoporti definiu uma nova estrutura organizacional, visando a descentralização das responsabilidades e a eficiência em suas atividades. Optou-se pela divisão em Núcleos de Trabalho e Programas Estratégicos.

Os núcleos são os espaços de organização interna da entidade e têm função executiva, sendo responsáveis pela realização de tarefas específicas determinadas pela Assembléia Geral ou indicadas pelo Conselho Diretor. Já os Programas Estratégicos têm como finalidade a consecução dos objetivos do Soylocoporti.

Cada núcleo e programa conta com um coordenador, eleito em Assembléia Geral, e todos os associados efetivos têm a liberdade de optar entre um dos núcleos e um dos programas para atuar. Os coordenadores, automaticamente, passam a compor o Conselho Diretor.

Núcleos de Trabalho:

• Secretaria e Comunicação;
• Finanças.

Programas Estratégicos:

• Formação, formulação e disputa;
• Articulação, mobilização e fortalecimento.